Recherche collaborative

sur les infections respiratoires aiguës, la tuberculose, la résistance aux antimicrobiens et les pathogènes émergents.

Recherche, AMR et Mère-Enfant

TRIuMPH

Types

Recherche, AMR et Mère-Enfant

Régions/Pays

Global – France, Madagascar, Malaisie, Pakistan et Pays-Bas

Contexte

Alors que de nombreux pays et organisations internationales soulignent la nécessité d’une surveillance One Health des bactéries résistantes aux antibiotiques dans la mise en œuvre des plans d’action nationaux pour la RAM selon l’OMS (WHO 2018), beaucoup de pays n’ont pas de système de surveillance en place, en particulier dans les secteurs de l’environnement et de l’animal. Une meilleure surveillance est particulièrement nécessaire pour les entérobactéries productrices de bêta-lactamases à spectre étendu (BLSE) et les entérobactéries productrices de carbapénémases (EPC), qui ont été déclarées priorité critique par l’Organisation mondiale de la Santé (OMS) (Tacconelli et al.2018).

Le protocole Tricycle développé selon l’approche « One Health » par le groupe OMS AGISAR (WHO AGISAR 2017), intègre la surveillance de la population humaine en bonne santé (portage chez les femmes enceintes) et des patients infectés (infections du sang) avec une surveillance dans le secteur animal (poulet) et le secteur environnemental (eaux usées humaines et animales et les eaux de surface).

Objectif

Le projet TRIuMPH a pour objectif :

  • L’amélioration du protocole TRICYCLE pour la surveillance de la RAM dans les 3 secteurs (humains, animaux et environnementaux) en élaborant de nouveaux protocoles pour :
    • la détection des entérobactéries productrices de carbapénémases (EPC) facilement applicables aux 3 secteurs, avec une méthode simple et peu coûteuse car les milieux commercialisés sont difficilement disponibles dans les LMICs.
    • la mise en place et l’utilisation de pipelines d’analyse WGS en open-source
  • L’extension du protocole Tricycle actuel :
    • à de nouvelles régions d’études (nouveaux sites)
    • à des échantillons provenant d’autres campagnes de surveillance comme la campagne de surveillance environnementale de la poliomyélite

Activités

  • Formation aux méthodes de détection et de caractérisation phénotypique des EPC.
  • Identification de nouveaux sites d’étude à l’échelle nationale des pays impliqués*
  • Prélèvements dans les trois secteurs (humain, animal et environnemental) et analyse phénotypique
  • Caractérisation moléculaire (analyse par Whole Genome Sequencing) des souches EPC isolées dans les trois secteurs

Impact

  • Capacités de diagnostic et de surveillance de la RAM des LMICs, pour les secteurs humain, animal et environnemental
  • Données sur la prévalence de E coli BLSE et de CPE dans les différents secteurs, indicateurs de résistance pour mesure l’impact de futures interventions
  • Contribution à la remontée des données RAM « One Health » aux autorités de santé
  • Développement d’un réseau international sur la RAM

Promoteur

  • Secrétariat JPIAMR (Joint Programming Initiative on Antimicrobial Resistance Call for Diagnostics and Surveillance), via l’agence nationale de financement
  • ANR pour la France
  • SIDA (Suède) pour Madagascar
  • IDRC (Canada) pour le Pakistan et la Malaisie

Partenaires

  • National Institute for Public Health and the Environment, Pays Bas
  • INSERM IAME UMR1137, University Paris-Diderot Medical School, Paris,
  • Utrecht University (Pays Bas)
  • National Institute of Health, Pakistan
  • Infectious Disease Research Centre of Institute for Medical Research, MOH, Malaisie
  • Centre d’infectiologie Charles Mérieux Madagascar
  • Fondation Mérieux (sous contractant de l’Inserm)